西禅院是过去的行宫院。在清代，菩萨顶是五台山备受皇家青睐的第一座寺院，康熙、乾隆曾多次在西禅院住宿。为什么会选该寺为行宫呢?说法有三：

       其一，民间传说，大清国入主中原，统二华夏之后的第一任皇帝顺治就是出家于菩萨顶。理由是顺治皇帝虽有三宫六院、七十二妃、八百姣娥-；后宫佳丽如云，但他爱情特别专一，白幸宠董鄂妃之后，对皇后在内的所有美女都不放在心上了。一年头上，董鄂妃生皇子，不久皇子夭折，董贵妃抑郁成疾。为保董鄂妃早日康复，顺治皇帝在太医百般疗治无效的情况下，开始让京城寺庙中的喇嘛为董贵妃念经驱邪，乞福平安。但却始终没能挽住董鄂妃的性命。顺治皇帝精神崩溃，寻死觅活，要殉妃而一同归天。后经皇太后等众人力阻未能如愿。殉妃不成，他就抱定主意要出家。他曾让阿旺老藏、老藏丹贝等大喇嘛在五台山为其寻找学法道场，并且让僧人为他落发。上述事情史志上有所记载。顺治皇帝对爱情专一远远超过了唐玄宗。虽然清史上记载了顺治皇帝于顺治十八年正月害天花而驾崩，但对于顺治出家之说至今仍是清朝四大疑案之一，而无定论。目前，五台山依然流传着好多有荆匝治出家五台山的传说。有的说顺治出家于五台山镇海寺，但更多的人认为他是出家于菩萨顶。康熙一生五次朝台，四次住宿菩萨顶；乾隆一生六次朝台，两次住宿于此。嘉庆也曾朝台一次。前赴后继，乐此不疲，人们便认为他们明为朝台，暗为寻找顺治的下落，找不见人，找见其骨也行。这便是康熙、乾隆对菩萨顶恩宠的原由之一。
   
　　其二，民间传说，康熙第一次朝台住宿于菩萨顶后，曾骑马闲逛，在台怀街遇民家美女梅枝，一见钟情，魂不守舍。他不好对手下人直抒胸臆，便写了一首打油诗放于桌上，后由手下人略施小计，梅枝便成了康熙的野妃，并为康熙生了一个儿子名叫宫云。宫云长到17岁时，康熙赠给他一枚提督印，并授其一柄斩杀剑，让其当了菩萨顶的大喇嘛。对于这一传说，清朝正史上没有记载，因为这毕竟有损于皇家声誉。但至今，人们还记得康熙皇帝于康熙二十二年，即公元1683年第一次朝台时所写的那首打油诗：
骑骏马，过皇庄，
偶遇一女碾黄梁。
轻起笤，慢簸扬，
几回辄步整容妆。
汗流满面花含露，
尘拂蛾眉柳带霜。
可怜这般窈窕女i
嫁与谁家曰舍郎?
   
　　康熙住宿于菩萨顶，撞发了桃花运，自然就对菩萨顶感情上非同于一般了。
   
　　其三，菩萨顶自北魏建寺以来，一直就是一座著名的寺院，地理条件优越，自然风光如画，文殊菩萨展现真容，高僧大德层出不穷。清朝统治者想以尊崇佛教达到怀柔蒙、藏、汉等各民族的目的，其住处当然是首选菩萨顶了。这条理由恐怕最具说服力。
   
　　行宫院以前陈设很好，后经历史变革，原样已不存在。现在的行宫院是1993年重建的。但现任住持认为重修得很不理想，现正在又一次重修。